Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NKX1-1Q15270 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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