Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRRQ15256 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRRQ15256 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PTPRRQ15256 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRRQ15256 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PTPRRQ15256 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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PTPRRQ15256 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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PTPRRQ15256 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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PTPRRQ15256 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PTPRRQ15256 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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