Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NCAPHQ15003 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NCAPHQ15003 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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