Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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RAB39AQ14964 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB39AQ14964 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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RAB39AQ14964 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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RAB39AQ14964 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RAB39AQ14964 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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