Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms