Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
RUNX3Q13761 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RUNX3Q13761 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms