Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SMAD4Q13485 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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