Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FOXE3Q13461 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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