Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TCOF1Q13428 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms