Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
AP3B2Q13367 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms