Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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SP140Q13342 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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SP140Q13342 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SP140Q13342 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SP140Q13342 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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