Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CLN3Q13286 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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