Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3FQ13275 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SEMA3FQ13275 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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