Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SRSF6Q13247 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
SRSF6Q13247 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.9 ms