Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
GPS1Q13098 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GPS1Q13098 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GPS1Q13098 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GPS1Q13098 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPS1Q13098 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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