Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIK2Q13002 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.4 ms