Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CSTF3Q12996 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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