Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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FOXF2Q12947 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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FOXF2Q12947 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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