Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LMAN2Q12907 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LMAN2Q12907 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms