Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
NFIAQ12857 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NFIAQ12857 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms