Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GPC5P78333 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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GPC5P78333 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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GPC5P78333 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GPC5P78333 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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