Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
HOXD10P28358 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
HOXD10P28358 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
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