Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPREP23469 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPREP23469 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPREP23469 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPREP23469 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPREP23469 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
PTPREP23469 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PTPREP23469 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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