Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
C9orf135Q5VTT2 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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