Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CTXN3Q4LDR2 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTXN3Q4LDR2 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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