Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ME3Q16798 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ME3Q16798 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ME3Q16798 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ME3Q16798 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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ME3Q16798 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ME3Q16798 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ME3Q16798 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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