Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
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SGCBQ16585 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
SGCBQ16585 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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