Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CCDC85BQ15834 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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