Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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SYCP1Q15431 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SYCP1Q15431 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SYCP1Q15431 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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