Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
IRF4Q15306 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IRF4Q15306 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms