Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
BRD3Q15059 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
BRD3Q15059 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.58□□□□□ -2
BRD3Q15059 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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BRD3Q15059 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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BRD3Q15059 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
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BRD3Q15059 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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BRD3Q15059 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
BRD3Q15059 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
BRD3Q15059 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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