Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
HERC3Q15034 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
HERC3Q15034 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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