Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CKAP5Q14008 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CKAP5Q14008 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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CKAP5Q14008 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CKAP5Q14008 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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