Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
C1DQ13901 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
C1DQ13901 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
C1DQ13901 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
C1DQ13901 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
C1DQ13901 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
C1DQ13901 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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