Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SHROOM2Q13796 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
SHROOM2Q13796 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms