| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.315-201 | ENST00000365117 | 102 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1040P-201 | ENST00000383974 | 107 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR559-201 | ENST00000385188 | 96 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR153-2-201 | ENST00000385225 | 87 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP181-201 | ENST00000410246 | 98 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL157709.1-201 | ENST00000412695 | 424 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCYBP10-201 | ENST00000424905 | 650 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | KCNMA1-AS2-201 | ENST00000428936 | 427 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL132875.2-201 | ENST00000436418 | 325 nt | TSL 5 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC007215.1-201 | ENST00000464893 | 276 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | TOMM22P6-201 | ENST00000465035 | 409 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC113383.1-204 | ENST00000507060 | 552 nt | TSL 3 BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC026436.1-201 | ENST00000510537 | 270 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC080078.3-201 | ENST00000605407 | 463 nt | BASIC | 2.33 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC073544.1-201 | ENST00000600110 | 1595 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU6-99P-201 | ENST00000364721 | 107 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | RNU6-700P-201 | ENST00000391043 | 107 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC009963.1-201 | ENST00000417265 | 157 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MS4A4E-203 | ENST00000425663 | 350 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01870-201 | ENST00000427042 | 390 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC018868.1-201 | ENST00000491307 | 315 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4ATAC17P-201 | ENST00000517272 | 120 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AP006219.1-201 | ENST00000580258 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC016727.2-201 | ENST00000603988 | 621 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC100812.1-201 | ENST00000607622 | 580 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL359314.1-201 | ENST00000616913 | 261 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ST7-OT4_2.1-201 | ENST00000619089 | 172 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL160413.1-201 | ENST00000622780 | 310 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC090574.1-201 | ENST00000623186 | 233 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCARNA15.3-201 | ENST00000626315 | 122 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1291-201 | ENST00000627649 | 87 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCARNA4.1-201 | ENST00000628597 | 123 nt | BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AGTPBP1-205 | ENST00000376083 | 4208 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | OR51A7-202 | ENST00000641490 | 2186 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.32 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD115-8-201 | ENST00000363856 | 82 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD115-38-201 | ENST00000365037 | 82 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR1294-201 | ENST00000408503 | 142 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU2-48P-201 | ENST00000410694 | 191 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS20P15-201 | ENST00000412792 | 311 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MIR2053-201 | ENST00000459295 | 91 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | HMGN1P13-201 | ENST00000505795 | 138 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | HMGB3P3-201 | ENST00000510526 | 400 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.706-201 | ENST00000516933 | 99 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC022616.8-201 | ENST00000533569 | 253 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC027288.2-201 | ENST00000553028 | 243 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02165-201 | ENST00000563061 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC090517.1-201 | ENST00000569307 | 266 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC004584.2-201 | ENST00000570407 | 410 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC067747.1-201 | ENST00000608026 | 250 nt | BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC148-202 | ENST00000409187 | 2523 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.31 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-874P-201 | ENST00000362390 | 105 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-490P-201 | ENST00000362985 | 107 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD114-30-201 | ENST00000364448 | 72 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.319-201 | ENST00000365138 | 92 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-26P-201 | ENST00000383985 | 107 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU1-52P-201 | ENST00000384190 | 164 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.463-201 | ENST00000384271 | 102 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.577-201 | ENST00000384794 | 101 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR549A-201 | ENST00000385268 | 96 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR190B-201 | ENST00000401119 | 79 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4ATAC16P-201 | ENST00000408512 | 126 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SMG7-AS1-202 | ENST00000432837 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC234781.5-201 | ENST00000508429 | 271 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | KRTAP13-6P-201 | ENST00000508999 | 371 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC096721.1-201 | ENST00000513540 | 552 nt | TSL 4 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA31.11-201 | ENST00000516528 | 139 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | MYL12BP1-201 | ENST00000569826 | 507 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | CYP2C61P-201 | ENST00000604072 | 290 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL080274.1-201 | ENST00000605565 | 220 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC046143.2-201 | ENST00000609789 | 160 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC243829.7-201 | ENST00000633081 | 225 nt | BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ARHGAP15-202 | ENST00000409869 | 2968 nt | TSL 5 BASIC | 2.3 | □□□□□ -2.04 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATP11C-201 | ENST00000327569 | 6115 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.29 | □□□□□ -2.04 | | |