Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NAE1Q13564 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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