Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TOP3AQ13472 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TOP3AQ13472 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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TOP3AQ13472 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TOP3AQ13472 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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