Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FOXE3Q13461 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms