Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
LSAMPQ13449 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
LSAMPQ13449 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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