Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
CHAF1BQ13112 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHAF1BQ13112 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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