Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL28Q13084 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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