Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
FOXF2Q12947 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
FOXF2Q12947 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms