Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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CNTN1Q12860 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CNTN1Q12860 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CNTN1Q12860 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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CNTN1Q12860 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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CNTN1Q12860 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CNTN1Q12860 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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