Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
TROAPQ12815 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
TROAPQ12815 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
TROAPQ12815 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
TROAPQ12815 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms