Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PGGT1BP53609 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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PGGT1BP53609 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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PGGT1BP53609 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGGT1BP53609 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGGT1BP53609 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
PGGT1BP53609 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PGGT1BP53609 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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