Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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USP18Q9UMW8 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
USP18Q9UMW8 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
USP18Q9UMW8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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