Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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