Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CLPPQ16740 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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