Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
CDKN3Q16667 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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