Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
NFE2Q16621 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NFE2Q16621 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms